Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdf3Q07104 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms