Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Sh3bp2Q06649 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp2Q06649 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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