Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms