Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a1Q05722 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms