Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nme2Q01768 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms