Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms