Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Top2aQ01320 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms