Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms