Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms