Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pitx2P97474 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pitx2P97474 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms