Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H3f3aP84244 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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