Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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