Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms