Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Vbp1P61759 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Vbp1P61759 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vbp1P61759 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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