Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snap25P60879 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snap25P60879 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snap25P60879 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snap25P60879 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms