Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp5bP56480 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms