Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PitpnbP53811 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms