Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
FmodP50608 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
FmodP50608 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
FmodP50608 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms