Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms