Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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