Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PpargP37238 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PpargP37238 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PpargP37238 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms