Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pou3f3P31361 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms