Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NapbP28663 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NapbP28663 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NapbP28663 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms