Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms