Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Psmb9P28076 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Psmb9P28076 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms