Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf1bP25119 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf1bP25119 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf1bP25119 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf1bP25119 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf1bP25119 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tnfrsf1bP25119 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tnfrsf1bP25119 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf1bP25119 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfrsf1bP25119 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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