Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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