Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms