Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms