Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PdgfaP20033 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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