Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Sptan1P16546 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Sptan1P16546 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Sptan1P16546 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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