Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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