Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms