Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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