Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P10404 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P10404 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
P10404 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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P10404 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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