Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm20744-201ENSMUST00000208972 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Mtmr6-203ENSMUST00000224366 1968 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prm2P07978 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms