Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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