Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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DffaO54786 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
DffaO54786 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
DffaO54786 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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