Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2O35245 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms