Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm2888K7N746 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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