Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms