Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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