Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms