Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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