Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubap1lG3UW59 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms