Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScaperF8VQ70 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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