Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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