Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms