Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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