Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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PtprbB2RU80 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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PtprbB2RU80 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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PtprbB2RU80 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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PtprbB2RU80 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms